Η νήσος Πιπέρι και η ευρύτερη θαλλάσια περιοχή γύρω του αποτελούν ουσιαστικά το κέντρο του Θαλάσσιου Πάρκου της Αλοννήσου. Το νήσι έχει μέγεθος 7 τετραγωνικών χιλιομέτρων, ενώ είναι ιδιαίτερα δυσπρόσιτο, αφού δεν υπάρχει ούτε ένας προστατευμένος όρμος για να καταλύσουν τα καΐκια.
Το Πιπέρι είναι το κέντρο της προστασίας της φώκιας monachous-monachous. Για αυτό τον λόγο απαγορεύται η προσέγγισή του σε απόσταση μικρότερης των 3 ναυτικών μιλίων. Ο λόγος είναι να εμπλουτιστεί πάλι η περιοχή με ψάρια, και να προστατευτεί η φώκια από την ανθρώπινη παρουσία.
